En su regreso a la Copa MX, Zacatepec Siglo XXI quedó sembrado en el Grupo 9, en el que compartirá créditos con León y Morelia.
Para el torneo de la Copa MX del Clausura 2017, el certamen iniciará el 17 de enero, bajo el mismo formato de cuatro partidos por equipo en la fase de grupo, además de los octavos de final, cuartos de final, semifinal y final.
El único cambio que tendrá esta Copa es que son nueve grupos –uno más que en el Apertura 2016–, de los que calificarán los primeros lugares de cada sector y los siete segundos mejores.
El campeón Gallos Blanco se ubicó en el Grupo 2, junto con Cruz Azul y Alebrijes. Participarán 15 equipos del Ascenso y 12 de la Liga MX.
Grupo 1
Tijuana
Correcaminos
Cimarrones de Sonora
Grupo 2
Querétaro
Cruz Azul
Alebrijes
Grupo 3
América
Coras FC
Santos Laguna
Grupo 4
Mineros Zacatecas
Puebla
Atlas
Grupo 5
Potros UAEM
Necaxa
Jaguares
Grupo 6
Guadalajara
Atlante
Venados
Grupo 7
Monterrey
Dorados
FC Juárez
Grupo 8
Celaya FC
Toluca
Veracruz
Grupo 9
Zacatepec Siglo XXI
León
Morelia
